Apple разработала нейросеть SimpleDesign для проектирования белков Исследователи Apple представили модель SimpleDesign, которая одновременно создает последовательности аминокислот и рассчитывает их пространственную структуру. В отличие от AlphaFold и большинства аналогов, система обходится без промежуточных токенов и обучена напрямую на парах «последовательность — 3D-координаты». В основу проекта легла предыдущая разработка компании SimpleFold. В ней метод сопоставления потоков (flow matching), напоминающий работу диффузионных генераторов изображений, объединили с архитектурой трансформеров. Обучение провели на базе из 2 миллиардов пар белковых данных. В процессе тренировки модель училась восстанавливать зашумленные координаты и маскированные аминокислоты, что позволило ей решать обе задачи как по отдельности, так и параллельно. На тестах SimpleDesign показала результаты на уровне специализированных систем. Однако пока все выводы сделаны только на основе компьютерного анализа — реальных лабораторных испытаний сгенерированные белки еще не проходили.