Транзистор, который дышит
Инженеры MIT
собрали транзистор из живой бактерии. Конструкция переключается, передаёт сигнал дальше и в связке с себе подобными выполняет логические операции.
Взяли Pantoea agglomerans — обычную бактерию, которая и так живёт на листьях растений. Из неё сделали две версии. Первая включается, когда до неё доходит определённый химический сигнал. Вторая работает наоборот. Обе умеют распознать ещё одну молекулу и выделить в ответ собственное химическое сообщение. Между ними посадили три штамма-ретранслятора: их работа — переводить сигнал одного «языка» в тот, который поймёт следующий элемент цепочки.
Дальше начинается инженерия. Колонии печатают на агаре в чашке Петри с шагом примерно 5 миллиметров — расстояние подобрано так, чтобы молекула доплыла именно до нужного соседа. В электронной схеме по проводам бегут электроны, здесь между колониями плывут молекулы. И планировку такой схемы можно перекроить, не переделывая каждый элемент заново.
На этой основе собрали сумматор из 24 колоний, схемы для операций ИЛИ и импликации, а ещё демультиплексор — узел, который направляет один входящий сигнал в разные стороны в зависимости от управляющего.
Зачем всё это, если есть кремний? Смысл в модульности. Обычно синтетические биологи запихивают все функции в одну клетку, и та в какой-то момент захлёбывается: белковая фабрика перегружена, компоненты мешают друг другу. Разнести функции по разным клеткам — способ обойти этот потолок.
Про скорость авторы говорят, что один расчёт занимает около восьми часов. Для процессора это катастрофа, для растения — обычный темп, оно живёт сутками и сезонами. В этом и план: посадить схемы на корни и листья, чтобы бактерии сами замечали засуху, вредителя или болезнь и, например, запускали выработку фунгицида.
@vselennayaplus